FreeSurfer 使用笔记
date
Oct 23, 2023
slug
freesurfer-use
status
Published
tags
FreeSurfer
summary
FreeSurfer 使用过程中的笔记
type
Post
先设置输出路径
自动重建命令
-i 是输入文件参数，后面跟文件名，输入文件可以是 nii 或 dcm 格式。
-subject 是指定输出文件夹名称，这里设置的 bert ，那么处理好的数据全都在 $SUBJECTS_DIR/bert 下。
-all 指的是做所有处理步骤，也可以只做一部分
后台多线程运行
这里 —jobs 8 意思是开8个线程，根据你的 CPU 线程数修改
通过以下命令查看 CPU 线程数